지금은 많이 위상이 위축되었지만 Journal of Molecular Biology (JMB) 는 분자생물학의 발전과 함께해온 업계의 중요 저널이다. 그렇다면 이 저널에서 가장 많이 인용된 10개의 논문은 어떤 것일까? 대부분이 방법론 내지는 바이오인포매틱 알고리즘 (의외로 JMB 에서는 중요한 바이오인포매틱 관련 논문들이 많이 등장한다) 으로 일반적인 연구자들에게 친숙한 것이므로 한번쯤 살펴볼 가치가 있을 듯 하다.
10. Studier et al., (1986) Use of bacteriophage T7 RNA polymerase to direct selective high-level expression of cloned genes.
대장균에서 단백질을 발현할 때 가장 많이 쓰이는 T7 RNA Polymerase - T7 Promoter 시스템, 즉 pET System 의 근본 원리는 위 논문에서 기술되었다.
9, Holm et al., (1993) Protein structure comparison by alignment of distance matrices
단백질 구조를 비교하는 알고리즘인 DALI 를 소개한 논문이다.
8. Sali et al., (1993) Protein structure comparison by alignment of distance matrices.
최초의 protein homology modeling 소프트웨어인 Modeller 의 근본 알고리즘에 대한 소개이다.
7. Murzlin et al., (1995)SCOP: A structural classification of proteins database for the investigation of sequences and structures
단백질/도메인의 구조에 따른 분류 데이터베이스인 SCOP 논문
6. Hanahan (1983) Studies on transformation of Escherichia coli with plasmids.
왕년에 유명했던 E.coli 형질전환법인 hanahan 법 (이라고는 하나 실제로 방법이 좀 귀찮기 때문에 한번도 이 방법으로 만들어본 적 읍다) 을 소개한 논문
5. Bernstein et al., (1977) The Protein Data Bank: a computer-based archival file for macromolecular structures.
PDB 가 1977년부터 있었다는 것 (그렇다면 Genbank 보다 오래된 것 아니던가?) 아시는 분 별로 없을듯.
4. Matthews (1968) Solvent content of protein crystals
Crystallography에 관련된 연구를 하는 사람이라면 누구나 알고 있는 (Unit cell parameter 와 MW 만 가지면 대략적으로 Unit Cell 내에 몇개의 단백질이 들어가는지를 짐작할 수 있게 해주는) Matthews coefficient의 개념은 여기서 소개되었다.
3. Southern (1975) Detection of specific sequences among DNA fragments separated by gel electrophoresis.
그 유명한 '써던 블랏' 의 오리지널 페이퍼.
2. Kyte and Dolittle (1982) A simple method for displaying the hydropathic character of a protein.
1. Altschul et al, (1990) Basic local alignment search tool
1위는 사실 의문이 없는 '1위 할만한' 논문이다. 근데 Basic local alignment search tool 이 뭔 듣보잡 툴이냐고? BLAST 말이다. 사실 BLAST 개발자인 Altschul 등은 이들이 현대 생물학 연구에 미친 영향력을 생각해 볼때 노벨상은 거의 예약되었다고 해도 다름이 없을 중요한 업적을 남겼다고 생각한다.
역시 인용빈도 짱 먹으려면 사람들이 다 쓰는 프로토콜이나 바이오인포매틱툴을 만들어야 할 듯 하다. ㅎㅎ
(여기서 중요한 것은 '프로토콜' 이나 '바이오인포매틱툴' 을 만들자가 아니라 '사람들이 다 쓰는' 이라는 것을 잊지 마시길.)
10. Studier et al., (1986) Use of bacteriophage T7 RNA polymerase to direct selective high-level expression of cloned genes.
대장균에서 단백질을 발현할 때 가장 많이 쓰이는 T7 RNA Polymerase - T7 Promoter 시스템, 즉 pET System 의 근본 원리는 위 논문에서 기술되었다.
9, Holm et al., (1993) Protein structure comparison by alignment of distance matrices
단백질 구조를 비교하는 알고리즘인 DALI 를 소개한 논문이다.
8. Sali et al., (1993) Protein structure comparison by alignment of distance matrices.
최초의 protein homology modeling 소프트웨어인 Modeller 의 근본 알고리즘에 대한 소개이다.
7. Murzlin et al., (1995)SCOP: A structural classification of proteins database for the investigation of sequences and structures
단백질/도메인의 구조에 따른 분류 데이터베이스인 SCOP 논문
6. Hanahan (1983) Studies on transformation of Escherichia coli with plasmids.
왕년에 유명했던 E.coli 형질전환법인 hanahan 법 (이라고는 하나 실제로 방법이 좀 귀찮기 때문에 한번도 이 방법으로 만들어본 적 읍다) 을 소개한 논문
5. Bernstein et al., (1977) The Protein Data Bank: a computer-based archival file for macromolecular structures.
PDB 가 1977년부터 있었다는 것 (그렇다면 Genbank 보다 오래된 것 아니던가?) 아시는 분 별로 없을듯.
4. Matthews (1968) Solvent content of protein crystals
Crystallography에 관련된 연구를 하는 사람이라면 누구나 알고 있는 (Unit cell parameter 와 MW 만 가지면 대략적으로 Unit Cell 내에 몇개의 단백질이 들어가는지를 짐작할 수 있게 해주는) Matthews coefficient의 개념은 여기서 소개되었다.
3. Southern (1975) Detection of specific sequences among DNA fragments separated by gel electrophoresis.
그 유명한 '써던 블랏' 의 오리지널 페이퍼.
2. Kyte and Dolittle (1982) A simple method for displaying the hydropathic character of a protein.
1. Altschul et al, (1990) Basic local alignment search tool
1위는 사실 의문이 없는 '1위 할만한' 논문이다. 근데 Basic local alignment search tool 이 뭔 듣보잡 툴이냐고? BLAST 말이다. 사실 BLAST 개발자인 Altschul 등은 이들이 현대 생물학 연구에 미친 영향력을 생각해 볼때 노벨상은 거의 예약되었다고 해도 다름이 없을 중요한 업적을 남겼다고 생각한다.
역시 인용빈도 짱 먹으려면 사람들이 다 쓰는 프로토콜이나 바이오인포매틱툴을 만들어야 할 듯 하다. ㅎㅎ
(여기서 중요한 것은 '프로토콜' 이나 '바이오인포매틱툴' 을 만들자가 아니라 '사람들이 다 쓰는' 이라는 것을 잊지 마시길.)
덧글
terra19 2009/06/25 17:51 # 삭제 답글
역시 blast군요.아직도 많은 연구자들이 자주 사용하고 있으니
그럴만하다고 생각합니다. ^ ^
Frey 2009/06/25 22:46 # 답글
BLAST가 Southern Blot에 비해 늦게 나왔는데도 인용 횟수가 더 많다는 건 놀랍군요^^; 전 15년이라는 격차가 있으니 Southern Blot이 더 많지 않을까 하고 생각했는데;;
2009/10/07 00:34 # 삭제 답글 
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