그림으로 보는 DNA Sequencing 원리 : Sanger에서 Solexa까지

영국의 Welcome Trust 페이지에서 찾은 플래시 애니메이션.


고전적인 Sanger Sequencing : '고전적' 이라고는 하나 근래에 이 바닥 일을 시작한 사람들이라면 시퀀싱이란 그저 '회사에 DNA 던져주면 되는 일' 이라고 생각하기 때문에 실제 원리를 잘 모르는 경우가 의외로 많다능~
(가끔은 '맹물' 던져주고 시퀀싱 안나온다고 찌질대는 중생들도 있고..ㅎㅎㅎ)

'고전' 이라고는 하나 여전히 정확도나 Read Length 면에서 Sequencing의 Gold Standard 로 통하며, Genomics 쪽에서의 활용도는 아무래도 줄어들겠지만 일반적인 연구용의 Sequencing으로써는 여전히 건재하다.







454 Sequencing : Roche 의 GS-FLX 라는 이름으로 이용되는 플랫폼으로 최초로 상용화된 NGS 플랫폼. Read Length 가 illumina 에 비해서 상대적으로 길기 때문에 De novo sequencing 에도 이용가능하다는 장점이 있으나, throughput 이 낮기 때문에 대개 Bacterial Genome, Bacterial Metagenome, amplicon sequencing 등의 한정된 용도에 사용되는 경향이 있다.







Illumina Genome Analyzer, aka 'Solexa' : 요즈음의 Personal Genome Sequencing에서 가장 각광받고 있는 기기이나 단점이라면 Read length 가 짧다는 것.







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by Newbie | 2009/08/08 09:16 | 트랙백 | 핑백(1) | 덧글(3)

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... http://medialab.egloos.com/1936485(플래쉬 3개) 플래쉬로 만든 화면은 참 깔끔하군요... ... more

Commented by woogui at 2009/08/10 15:50
와! 정말 좋은 정보 얻어갑니다;ㅅ;
illumina사의 solexa sequencing을 이용한 데이터를 지금 굴리고 있는데 원리 모르는 랩원들에게 미팅때 보여주면 다들 좋아할 것 같네요~
Commented by saemi at 2009/10/16 16:48
개인소장으로 컴터에다가 저장할 수는 없을까요?
Commented by Newbie at 2009/10/17 05:12

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