Media Lab

이번 주 목요일에는 미쿡추석, Thanksgiving. 

여기서 떠드는 것은 현 시점에서는 그저 구라일뿐. 혹시 국내에도 이런 업체가 생길지 모르는데(이미 있나? ㅠㅠ) 이런 소리에 속아서 돈낭비하지 않도록 주의바란다. 몇십년 후의 미래에는 일부는 가능할런지 모르겠지만 지금은 안된다.

Pymol이라는 프로그램을 들어본 적이 없는 사람이라고 해도
생물학 전공자로 소위 CNS 류의 저널을 들춰본 적이 있는 사람이라면 단백질 결정구조에 의해서 그려진 여러가지 단백질
구조 그림들을 쉽게 접해 봤을 것이다.


타미플루가 influenza virus neuramidase에 들러붙어 있는 모습. 역시 Pymol 에 의해 그려졌다.

몇 년 전에 Pymol 이 등장하기 전만 하더라도 단백질 구조를 그리기 위해서 사용되는 프로그램들은 극히 원시적인 편이었다. 인터렉티브한 환경이 아닌 커맨드 라인을 기반으로 하는 프로그램, 혹은 인터렉티브한 환경이지만 그다지 플렉시블하지 않다든지..따라서 단백질 구조를 들여다보고 이리저리 그림을 그려보는 일은 극히 일부의 단백질 구조를 연구하는 사람들에 국한된 기술이었다.

그러나 몇 년전에 등장한 Pymol 이후에 모든 것이 바뀌었는데, 즉 비교적 유저 프랜들리한 인터렉티브한 메뉴를 가지고 있으면서도 명령어 방식에 의한 그림그리기를 지원하는 이 프로그램은 거의 단백질 구조 그리기 분야를 석권해 버렸다.



오픈소스 프로젝트로 시작하였으나 몇 년 전에 상용으로 전환하긴 했지만, 여전히 소스포지에서 소스를 받아서 스스로 컴파일하는 경우에는 무료로 사용할 수 있고, 이전 버전의 경우에는 기능 제약없이 사용할 수 있다는 꽤 대인배스러운 면모도 보여주고 있다.

그런데 문제는...제작자인 Warren Delano가 11월 3일 갑자기 37세를 일기로 타계했다라는 것이다.
추모페이지


일단 고인의 명복을 비는 것이 우선이겠고..

명복을 비는 모금운동

그러나 단백질 구조를 연구하는 사람으로써는 매일매일 일상적으로 사용하고 거의 밥줄이라고 말해도 될 프로그램을 거의 혼자서 개발하다시피하던 사람이 세상을 떠나서 더이상 프로그램이 업데이트되지 않는 것이 아닐까 하는 불안감도 이에 못지않게 크다. 다행히도 상용화되기는 했지만 개발 과정은 현재까지 오픈소스를 유지하고 있는 관계로 개발이 중단되지는 않을 것 같다는 안도감도 들긴 하지만...어쨌든 고인의 유지를 이어 누군가가 계속 이 프로그램을 개발해 주지 않는다면 상당히 곤란한 지경에 처하는 사람도 많을 듯 하다.

루저녀 소동으로부터 한 가지 긍정적인 희망을 살펴본다면,